Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CCDC96Q2M329 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC96Q2M329 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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