Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSPP1Q1MSJ5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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