Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IMPG1Q17R60 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms