Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PDK4Q16654 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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