Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIK5Q16478 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms