Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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