Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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