Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA2Q15822 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms