Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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