Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RYR3Q15413 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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