Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RFTN1Q14699 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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