Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IHHQ14623 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IHHQ14623 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IHHQ14623 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms