Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBFBQ13951 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBFBQ13951 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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