Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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CUL1Q13616 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CUL1Q13616 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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CUL1Q13616 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CUL1Q13616 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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