Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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