Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE3BQ13370 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE3BQ13370 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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