Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPA4Q13156 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPA4Q13156 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms