Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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