Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM2Q13029 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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