Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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