Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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