Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTP4A2Q12974 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTP4A2Q12974 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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PTP4A2Q12974 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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