Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PTPN13Q12923 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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PTPN13Q12923 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPN13Q12923 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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