Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIN2AQ12879 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIN2AQ12879 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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