Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NFIAQ12857 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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