Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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