Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms