Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F3Q08477 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms