Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
LRP1Q07954 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
LRP1Q07954 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -1
LRP1Q07954 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRP1Q07954 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
LRP1Q07954 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms