Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms