Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GRIN1Q05586 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms