Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN12Q05209 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms