Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNT1Q02742 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms