Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BAALC-AS1-202ENST00000500902 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC01579-206ENST00000556928 657 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CCL7-201ENST00000378569 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms