Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2BQ00403 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2BQ00403 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms