Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms