Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRX3P78415 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRX3P78415 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRX3P78415 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRX3P78415 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRX3P78415 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRX3P78415 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IRX3P78415 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms