Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms