Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD23BP54727 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms