Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF143P52747 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms