Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSRP3P50461 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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