Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ME1P48163 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ME1P48163 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ME1P48163 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ME1P48163 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ME1P48163 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ME1P48163 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ME1P48163 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ME1P48163 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms