Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms