Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFSF9P41273 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms