Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GGCXP38435 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms