Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC13P31276 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms