Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms