Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMO2P25791 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms