Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFE3P19532 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFE3P19532 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFE3P19532 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFE3P19532 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms