Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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